Как ни странно, но IPB некоррктоно работает с базами MYSQL 5.

Если например Вы переносите базу из MySQL 4, то она конечно встает нормально, но если сделать бэкап, а затем восстановить у Вас возникнет ошибка.

Сам я лично пробовал несколько раз ни как не проходит.

Поэтому рекомендую использовать MYSQL 4.1.13a, которую я опробывал.